香港公司將國內(nèi)公司股份出售，在香港：根據(jù)香港《稅務(wù)條例》，利得稅的課稅范圍為，任何人士，包括法團(tuán)、合伙業(yè)務(wù)、受托人或團(tuán)體，在香港經(jīng)營行業(yè)、專業(yè)或業(yè)務(wù)而從該行業(yè)、專業(yè)或業(yè)務(wù)獲得于香港產(chǎn)生或得自香港的應(yīng)評稅利潤（售賣資本資產(chǎn)所得的利潤除外)，均須納稅。香港公司轉(zhuǎn)讓其持有的境內(nèi)公司的股權(quán)所得收入，實則來源于中國內(nèi)地，非來源于香港，也非于香港產(chǎn)生，因此，不適用香港的利得稅。同時，香港不征收資本利得稅。

香港公司將國內(nèi)公司股份出售，在內(nèi)地：根據(jù)《企業(yè)所得稅法》第四條第二款規(guī)定，非居民企業(yè)取得本法第三條第三款規(guī)定的所得，適用稅率為20%。同時，該法第二十七條第五款規(guī)定，本法第三條第三款規(guī)定的所得符合減稅和免稅的條件。緊接著，《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》（下稱"《企業(yè)所得稅法實施條例》"）第九十一條規(guī)定，非居民企業(yè)取得企業(yè)所得稅法第二十七條第（五）項規(guī)定的所得，減按10%的稅率征收企業(yè)所得稅。因此，香港公司轉(zhuǎn)讓其持有的境內(nèi)公司的股權(quán)按10%的稅率征收企業(yè)所得稅。

根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)<非居民企業(yè)所得稅源泉扣繳管理暫行辦法>的通知》（國稅發(fā)【2009】3號）（下稱"3號文"）第三條的規(guī)定，對非居民企業(yè)取得來源于中國境內(nèi)的股息、紅利等權(quán)益性投資收益和利息、租金、特許權(quán)使用費所得、轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)所得以及其他所得應(yīng)當(dāng)繳納的企業(yè)所得稅，實行源泉扣繳，以依照有關(guān)法律規(guī)定或者合同約定對非居民企業(yè)直接負(fù)有支付相關(guān)款項義務(wù)的單位或者個人為扣繳義務(wù)人。扣繳義務(wù)人與非居民企業(yè)首次簽訂與本辦法第三條規(guī)定的所得有關(guān)的業(yè)務(wù)合同或協(xié)議（以下簡稱合同）的，扣繳義務(wù)人應(yīng)當(dāng)自合同簽訂之日起30日內(nèi)，向其主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報辦理扣繳稅款登記。